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全基因组表达谱芯片
2023-12-26
全基因组表达谱芯片1.差异基因筛选 对于每个实验组有三次以上生物学重复的实验设计,我们应用T检验筛选任意两个实验组之间差异表达的基因。方差分析(ANOVA)则用于从三个以上实验组筛选差异表达的基因。Aksomics除了提供常规的通过p值筛选的差异基因,还提供通过FDR筛选的差异基因。与p值筛选相比,FDR筛选对多重筛选过程中的假阳性率进行控制,是一种更加严谨的筛选方法。 ...
miRNA芯片
2023-12-26
miRNA芯片miRNA芯片技术服务基本数据分析结果展示1. miRNA差异表达数据 通过芯片中位值对miRNA芯片原始信号值进行标准化。通过标准化信号值计算出每个miRNA在不同样品间的表达变化(fold change),并通过t-test计算样品间miRNA表达量显著性p值。针对多重比较,p值被校正为FDR。根据倍数变化,p值或者FDR等参数筛选差异表达的miRNA。 ...
环状RNA芯片
2023-12-26
环状RNA芯片 环状RNA(circRNA)是一类由特殊剪接机制形成的、具有闭合环状结构、大量存在于真核转录组中的非编码RNA;也是目前生命科学和医学领域的研究热点分子。circRNA分子的组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征,使得circRNA作为临床疾病的biomarker具有明显的优势。近来研究显示,环状RNA在不同物种中起到miRNA海绵的作用,称之为竞争性内源RNA(...
LncRNA芯片
2023-12-26
LncRNA芯片基本数据分析1. 差异LncRNA的筛选 对于每个实验组有三次及三次以上生物学重复的实验设计,我们应用T检验筛选任意两个实验组之间差异表达的LncRNA,方差分析(ANOVA)则用于从三个以上实验组筛选差异表达的LncRNA,并以邻近(<100kb)mRNAs进行注释。Aksomics除了提供常规的通过p值筛选的差异LncRNA,还提供通过 FDR筛选的差...
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