miRNA测序
2023-12-26miRNA测序miRNA测序基本数据分析结果展示1.测序数据统计Sample NameClean Reads*Adaptor Trimmed**microRNA Reads***Z381-FCort7,237,4567,000,1065,906,193Z381-PCort7,483,2177,199,6375,743,606* 图释 ：*: 通过Illumina质控的高质量read的数目;*...
全基因甲基化测序
2023-12-26全基因甲基化测序全基因组甲基化谱1. 甲基化峰识别 通过MACS软件，可以利用与基因组匹配的read来识别甲基化峰，常用的MACS筛选参数：q-value≤ 10-4 。* mRNA相关的甲基化峰识别 * lncRNA相关的甲基化峰识别 * Small_ncRNA相关的甲基化峰识别 上表： 全基因组甲基化谱数据列表差异甲基化区域1. 识别差异甲基化基因 通过diffR...
m6A测序
2023-12-26m6A测序m6A（N6-methyladenosine，6-甲基腺嘌呤）是真核生物mRNA内部序列中最常见的一种甲基化修饰，同时可以功能性的调节真核生物的转录组从而影响mRNA的剪接、出核、定位、翻译和稳定。m6A RNA出现在多种重要的细胞生命过程中，意味着mRNA甲基化参与了多种生物学过程，如干细胞分化、生物节律等，同时也参与了多种疾病的发生，包括肿瘤、肥胖和不育等。 图1：m6A甲基化...
单细胞测序
2023-12-26单细胞测序单细胞全基因组测序是在单细胞水平对全基因组进行扩增与测序的一项新技术。其原理是利用MDA或MALBAC技术对分离的单细胞中微量全基因组DNA进行高效扩增，获得高覆盖度的完整基因组后进行高通量测序，生物信息学分析获得细胞中的遗传变异信息，可用于揭示细胞群体差异和细胞进化关系。样品要求1) 细胞分离：由合作方完成单细胞分离；2) 由公司寄出样品保存液（ MA...
LncRNA测序
2023-12-26LncRNA测序长链非编码RNA（long non-coding RNA）是一类长度大于200bp，不编码蛋白的RNA，广泛存在于生物体内。lncRNA测序可选择采用去除rRNA或DSN真核生物全转录组建库的方法进行文库构建，利用高通量测序技术，一次性获得单碱基分辨率的lncRNA序列信息，依托强大的生物信息分析平台，鉴定已知lncRNA，并预测新的lncRNA及其靶标。样本要求
CircRNA测序
2023-12-26CircRNA测序环状RNA（circular RNA，circRNA）是一类闭合、成环的非编码RNA分子，对核酸酶不敏感，半衰期较线性RNA长。circRNA广泛存在于动植物中，研究显示其能够通过竞争性结合microRNA在转录后水平进行调控。基于高通量测序技术，通过去除rRNA同时去除线性RNA的链特异性文库可一次性获得单碱基分辨率的circRNA序列信息。依托强大的生物信息分析平台，可...
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