知识分享：LncRNA芯片

基本数据分析

1.   差异LncRNA的筛选

       对于每个实验组有三次及三次以上生物学重复的实验设计，我们应用T检验筛选任意两个实验组之间差异表达的LncRNA，方差分析（ANOVA）则用于从三个以上实验组筛选差异表达的LncRNA，并以邻近（<100kb）mRNAs进行注释。Aksomics除了提供常规的通过p值筛选的差异LncRNA，还提供通过   FDR筛选的差异LncRNA。与p值筛选相比，FDR筛选对多重筛选过程中的假阳性率进行控制，是一种更加严谨的筛选方法，更适合于生物学重复较多的临床样本。

       适用范围：一般用于两组或多组实验状态下的比较，建议每组实验至少有3次生物学重复。